扣人心弦的《血色星期二》第二部再次席卷而来天赋黑客高木藤丸（三浦春马 饰）这次又会遇到什么随手的效果呢？ 第一部的最后，藤丸和其冤家力挽狂澜地阻止了病毒危机而这次他们面临的则是愈加令人恐惧的核弹恐惧方案。在病毒危机终了后两年，受其影响的藤丸决议再也不碰电脑，可是他还是不能组织自己和冤家九条音弥（佐藤健 饰）、高木遥（川岛海荷 饰）被卷入到新的方案当中。载有核弹的飞机正在一点点向东京迫近，而东京的群众却毫不知情，为了防止东京遭遭到核弹的重创，藤丸和音弥不得不继续末尾奋战。而他们所面对的除了老对手折原玛雅（吉濑美智子 饰）和神崎润（成宫宽贵 饰）外，还有许多新人。而结果终究如何呢？