阅历了常人难以想象的磨练和考验，艾伦·叶卡（三浦春马 饰）与阿明·阿诺德（本乡奏多 饰）以及其他有着不同背景的年轻人终于成为了合格的调查兵团成员。他们奉命停止首度墙外调查，结果却遭遇了可怕巨人的围猎，伤亡沉重。为了挽救好友，艾伦丧身巨人之口，谁知在巨人的腹中，他体内的奥秘基因醒悟。 化身为巨人的艾伦狂怒暴走，以压倒性的实力击败了一波又一波的巨人。恶战事先，艾伦恢恢复形，他的突变也惹起政府的高度关注。苏醒之中，觉醒久的回想悄然提醒着艾伦体内所隐藏的秘密，以及家族所遭受的惨剧。当艾伦面临被处决的厄运之时，铠甲巨人突然闯入将其掳走。 在一个隔绝的房间内，艾伦与敷岛（长谷川博己 饰）面对面。关于巨人，关于调查团，关于这个世界一切的秘密昭然若揭……