明治维新运动后十二年，日本迎来了新时代。曾经叱咤风云的刽子手绯村剑心如今已成为战争主义者，与冤家们一同在东京过着安静的生活。一天早晨，剑心最喜欢的餐厅遭到炮火袭击，只留下一张写着“人诛”的字条——有人预备替天行道，审问之日近在眼前。此人名为雪代缘，对剑心胸恨在心，带着一众手下前来复仇。目击有数无辜之人被牵扯进这场严酷的妥协，剑心终将面临一场审问，并由此找到对过去的救赎。